CTC的检测方法
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利用免疫亲和或物理特性法可富集到CTC,接下来还需要结合有效的下游分析方法。一方面,由于目前CTC捕获技术不能保证百分之百的纯度,需要对所得到的细胞进行鉴定,以进一步确定CTC细胞的数目,以减少CTC数目判定的假阳性率和假阴性率。另一方面,在肿瘤的发生发展过程中,不仅CTC的数目在动态的变化,CTC所携带的分子标志物也在变化,通过对CTC表面标志物检测,能够反应肿瘤发生发展的动态变化,是研究肿瘤发生发展机制的有效策略,并能很好地指导临床治疗。常用的CTC检测技术如免疫荧光、PCR、FISH及高通量测序等。
CTC检测技术比较

1.免疫荧光法(IF)实体肿瘤细胞一般均为上皮来源,细胞内会表达角蛋(cytokeratin,CK)或其他肿瘤标示物(如HER2)。借助免疫荧光染色,可对来自实体瘤CTC中的瘤标进行识别,从而达到检测CTC的目的。这也是目前检测CTC的最常见方法。缺点是,在CTC形成过程的间质化(EMT)阶段,大量的CK会降解,从而在CTC检测过程中出现因―看不见‖而造成的假阴性。
2.荧光原位杂交(FISH)荧光原位杂交,是根据已知细胞内特异的DNA序列,以利用荧光标记的特异寡聚核苷酸片段作为探针,与细胞内的基因组中DNA分子杂交,检测该特异基因序列的存在与丰度。FISH技术与CTC结合,不仅可以检测CTC表面标志物,也可以检测CTC细胞内部的标志物及核型等。
3.RT-PCR反转录PCR。提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用引物和逆转录酶将mRNA反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。结合RT-PCR可同时对若干个基因的表达进行检测。位点特异性PCR技术可用于检测CTC携带的驱动基因的突变情况。
4.二代测序CTC数量少,直接进行二代测序难度大。需要将单细胞的DNA扩增后,再利用二代测序检查基因序列。比较有代表性的是多重退火和成环循环扩增技术和多重臵换扩增(MDA)。但是,目前单细胞测序的技术仅仅停留在实验室阶段,未来向市场推广还有很长的路要走。而且由于肿瘤细胞的异质性,单细胞测序是否有代表性还需要更多的科学研究来证明。
2.荧光原位杂交(FISH)荧光原位杂交,是根据已知细胞内特异的DNA序列,以利用荧光标记的特异寡聚核苷酸片段作为探针,与细胞内的基因组中DNA分子杂交,检测该特异基因序列的存在与丰度。FISH技术与CTC结合,不仅可以检测CTC表面标志物,也可以检测CTC细胞内部的标志物及核型等。
3.RT-PCR反转录PCR。提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用引物和逆转录酶将mRNA反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。结合RT-PCR可同时对若干个基因的表达进行检测。位点特异性PCR技术可用于检测CTC携带的驱动基因的突变情况。
4.二代测序CTC数量少,直接进行二代测序难度大。需要将单细胞的DNA扩增后,再利用二代测序检查基因序列。比较有代表性的是多重退火和成环循环扩增技术和多重臵换扩增(MDA)。但是,目前单细胞测序的技术仅仅停留在实验室阶段,未来向市场推广还有很长的路要走。而且由于肿瘤细胞的异质性,单细胞测序是否有代表性还需要更多的科学研究来证明。
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