新一代创新:第三代基因测序
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第三代测序技术是指在单个细胞、单分子水平上对基因组进行测序的一项新技术,主要包括:HelicoBioscience单分子测序技术;PacificBioscience单分子实时(Singlemoleculerealtime,SMRT)测序技术和OxfordNanopore纳米孔单分子测序技术3种。第三代测序为单分子测序,不同于NGS依赖于DNA模板PCR扩增,使DNA模板与固体表面相结合然后边合成边测序的方法,它不需要进行PCR扩增,直接将单链与六寡聚核苷酸探针杂交,由于探针与连接了基因组文库片段的纳米孔阵列相结合,因此通过检测每个孔离子电流的变化即可确定探针杂交在每个基因组片段上的位置。第三代测序技术具有测序速度快、测序序列长等优势,但其也存在一个重大的技术瓶颈,就是测序准确度的问题,大大限制其商业化的应用。2016年6月,中科院昆明动物研究所研究员马占山与美国马里兰大学叶承曦博士的合作团队将第三代基因测序技术错误率高的技术难题彻底解决,从而推进基因测序技术迈向三代技术的产业升级。第三代基因测序技术仍在不断研究和完善的过程中,短期内,市场仍将以二代高通量测序技术为主导。
单细胞测序流程图

三代基因测序技术的比较

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