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液态活检面临的主要问题

来源:中为咨询www.zwzyzx.com 【日期:2016-08-11 11:44:30】【打印】【关闭】
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1、中晚期癌症检测技术相对成熟,价格较高,推广难度大
目前,对于III-IV期的癌症患者,其ctDNA检测准确率大部分都超过90%,技术上已经不具有难度。对于已知突变的检测方法,如ddPCR,ARMS等技术,虽然价格相对较低,但不能高通量检测,未来应用有限。基于NGS的液态活检项目通量高,能够检测未知突变,但是目前价格太高,市场接受度低。以华大基因个性化诊疗检测Oseq-T为例,该方法检测508个基因,官网上标价为14800元,普通民众目前难以接受如此高昂的价格。未来可能的解决方法:一方面,可以先利用低通量的,价格相对较低的检测方法检测已知突变,如果不能检出,再进行高深度的二代测,相对可行。另一方面,未来随着测序技术的发展NGS的价格有望进一步下降。

2、癌症早期筛查难度大,技术不成熟
在前文提到的图表中,我们可以看到,即使采用目前灵敏度高的基于NGS的CAPP-Seq等技术,在I期的非小细胞肺癌中检出率也仅为50%。其他的检测方法,如ddPCR,BEAMing,二代测序也存在同样问题,对于I期的各种癌症检测出率都在50%左右。由此可见,由于癌症早期ctDNA含量低,目前还难以达到准确检测的要求,技术瓶颈有待突破。未来可能的解决方法:癌症早期筛查的主要原因在于ctDNA含量低,未来靶向富集,将富集的DNA进行超高深度的测序将是未来可能的解决方案。目前的技术瓶颈在于高效准确的富集目的DNA片段并准确测序,随着技术的发展,未来有可能实现突破。

3、ctDNA的关注点或产品相对比较单一,产品间区分度较弱
从目前的研究现状来看,ctDNA的关注点或产品相对比较单一,大部分都是围绕肺癌EGFR/ALK等少数几个靶向治疗位点;不同液态活检公司的推出的GenePanel(基因筛查面板)相似度也很高。整个液态活检领域关注点比较单一,产品间区分度低。未来可能的解决方法:目前关注点单一主要是由于研发进展决定的,未来更多基因突变与靶向药物的关系有待科学研究去证实。产品区分度低,主要是由于“基因和蛋白作为自然存在的事物不能被申请专利”造成的。即使公司研究发现了某基因与疾病相关,该公司也不能将检测这个基因作为专利占有。这就要求这些生物公司只能开发出最有效检测标志物的技术才能在市场上占有优势。

4、肿瘤异质性大,部分肿瘤类型很难检测到ctDNA或CTC
研究发现,只有不到50%的髓母细胞瘤、转移性肾癌、前列腺癌或甲状腺癌,以及不到10%的胶质瘤患者可以检测到ctDNA,而在超过75%的晚期胰腺癌,卵巢癌、结直肠癌、膀胱癌、胃癌、乳腺癌、黑色素瘤、肝癌以及头颈癌可以检测到ctDNA。这可能会限制ctDNA在液态活检中的应用。未来可能的解决方法;未来随着检测灵敏度和准确度的提高,有可能某些含量低的肿瘤也能够被检测。对于这些ctDNA和CTC含量低的无法检测癌症,由于外泌体所含信息量更丰富,有可能未来会有突破。
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